Darkthrone begannen als Death Metal-Band, aber Ende 1990 und Anfang 1991, als sie das Material probten, das schließlich zu Goatlord werden sollte, entwickelten Nocturno Culto, Zephyrous und Fenriz Interesse am Black Metal. Bald beschlossen sie, die Goatlord-Sessions abzubrechen, weil das Material nicht das widerspiegelte, was sie fühlten, und begannen, die Songs zu komponieren, die auf A Blaze in the Northern Sky zu finden waren. Dag Nilsen war das einzige Mitglied, das noch technischen Death Metal spielen wollte, also nahm er die Basslinien für A Blaze in the Northern Sky auf und verließ dann die Band.

Der Name der Band wurde von einem dänischen Zine aus der Zeit um 1985/86 namens Blackthorn inspiriert, das von den Jungs der dänischen Band DesExult geschrieben wurde, sowie von den Texten des Celtic Frost-Songs "Jewel Throne" (I'm the king, Sitting im Dunkeln versteckt vor den Schatten des Windes/.../ Während ich vom Juwelenthron zum Portal der Unendlichkeit schaue).

Darkthrone sind dafür bekannt, dass es aus verschiedenen Gründen nur sehr wenige Live-Auftritte gab. Das bis dato allerletzte Konzert fand 1996 statt und war ebenfalls eine einmalige Veranstaltung.

Laut der Dezember-Ausgabe 2007 des Decibel Magazine wurde das Logo der Band von Tomas Lindberg von At the Gates entworfen. Dies wurde von Lindberg selbst in einem Interview mit dem MetalSucks Podcast 2014 bestätigt.